Los socios son entidades con las cuales el Instituto mantiene una vinculación de trabajo, con el propósito de atender las necesidades de cooperación técnica en los países miembros, sobre alimentación y nutrición:

1. Organizaciones del Sistema de Naciones Unidas (OPS/OMS, UNICEF, PMA, FAO)

2. Organismos del sistema interamericano (OEA, IICA)

3. Secretarías e instituciones del sistema de la integración centroamericana (SG-SICA, CC-SICA, CAC, CCAD, CECC, COMMCA, CRRH, CEPREDENAC, FEMICA, FOCARD APS)

4. USAID

5. Center for Disease Control –CDC–

6. Family Health International –FHI 360–

7. University Research Corporation –URC–

8. Save the Children

9. Corporación RAND

10. Unión Europea

11. Universidades: Johns Hopkins, Harvard, Michigan.